作物茎秆生长速度过快，抗倒伏能力下降，容易被风吹折或吹断。
作物抗逆能力下降，容易感染病害，遭受冻害。
作物的磷钾元素和微量元素吸收量下降，导致作物开花结果时间推迟，开花结果率下降。
作物吸收水分以及养分效率下降，且容易出现氨气中毒。
土壤酸化、盐碱化。
一、作物徒长
1、氮肥施加过多，会导致作物茎秆生长速度过快从而变得十分细长，容易被折断。
2、氮肥施加过多，土壤中氮素过剩，会导致作物细胞壁变薄，组织十分柔弱。
3、氮肥施加过多，叶片过大，植株间过于郁闭，田间通风透气性下降。
二、抗逆能力下降
氮肥施加过多，会降低作物的抗逆能力，从而加重作物感染病害以及遭受冻害的影响。
三、其他营养元素吸收量下降
氮肥施加过多会影响到磷、钾元素和其他微量元素的吸收，进而导致作物花芽分化率下降，开花坐果时间延迟，开花结果率下降，果实品质变差，畸形果概率较高。
四、作物肥害
1、氮肥施加过多时，会导致土壤溶液浓度升高，从而增大渗透阻力，阻碍作物根系部分吸收水分以及养分，进而导致作物死亡。
2、氮肥施加过多时，土壤水溶氮含量高，容易转化成氨气或硝酸气体并不断逸发至作物生长环境中，从而导致作物氨气中毒（空气氨浓度达到5mg/kg时，叶片受到伤害；空气氨浓度达到40mg/kg时，叶片组织坏死，叶绿素解体，叶脉间出现褐色斑点或斑块）。
五、土壤酸化
氮肥施加过多时，会引发并加重土壤酸化以及盐碱化，并且会诱发作物缺钙、缺镁症状。原理：氮肥过剩时，于土壤中转化成硝酸盐（硝化作用），而硝酸盐不被土壤胶体吸附，流动性大，在流失时会将土壤中大量的钙、镁等碱性盐基离子带走，从而导致土壤酸化。