土壤中的根螨可以通过药液灌根、耕翻冬灌等方式灭杀。
药液灌根：用20%双甲脒乳油1000-1500倍液浇灌植株的基部，或浇灌48%毒死蜱乳油1000-1500倍液，药液渗入土壤后即可灭杀根螨。
耕翻冬灌：耕翻土壤时可以杀伤根螨，部分被翻到土壤表面的根螨会被晒死，而进行冬灌可直接灭杀在地下休眠的螨体。
一、如何灭杀土壤中的根螨
1、药液灌根
用48%毒死蜱乳油1000-1500倍液浇灌植株的基部，或浇灌20%双甲脒乳油1000-1500倍液，或40%乐果乳油1500倍液，或5%噻螨酮乳油4200倍液，或20%甲氰菊酯乳油4000倍液，或1.8%阿维菌素乳油1000-1500倍液，待药液渗入土壤中后即可灭杀根螨。
2、农业措施
（1）收获后，彻底清理田间的植株残体，然后集中烧毁。
（2）适时耕翻、冬灌，耕翻机械可以杀伤土中的螨体，或将根螨翻至地面晒死，而进行冬灌则可以直接灭杀在土壤中休眠的根螨。
（3）适期早播，早播田块受到根螨的危害程度一般比较轻。对于严重受害的田块，可轮作小麦、大麦等作物。
3、使用无虫繁殖材料
（1）将无虫的繁殖材料作为基质，调运的寄主秧苗或鳞茎应加强检验，及时淘汰带虫秧苗或鳞茎，发现螨体时要立即消毒，防止根螨扩散。
（2）插种秧苗前，用5%噻螨酮乳油2000-3000倍液（或20%哒螨灵可湿性粉剂3000-40倍液）将根部浸泡5-10分钟。
二、根螨是怎么生成的
1、根螨1年可以发生多次，所以世代重叠情况较严重，当它们的生存环境恶化时，第1代若螨进入休眠，期间不食不动（在此状态下根螨对不良环境具有较强的抵抗力，不会受到寒冷、燥热、短期内缺少食物等问题的影响），待环境转好后会发育成第2代若螨。
2、根螨喜欢生活在土壤中，对温度的适应范围较广，当平均气温为10-30℃时，它们可以正常发育、活动，当气温低于10℃时，根螨会停止活动。
3、根螨行动迟缓，避光性较强，当土壤中的温湿度较适宜时，根螨的数量会快速增加。
4、罗宾根螨常出现在连作的洋葱田、潮湿且富含有机质的土壤中，且晚播田块一般比早播田块更容易发生。