进入雨季是棉株生长发育最旺盛时期，也是决定棉花产量、质量的关键时期。
一、控制肥水。进入雨季，棉花即长枝叶又增蕾结铃，对肥水的需求达一生高峰，应适时追肥，谨防脱肥早衰。但由于雨季雨水相对偏丰，极利于各种肥效的发挥而导致棉株旺长、疯长。因而，在追肥的同时还应做到：1、对底肥充足，苗肥量大的棉田应少施或不施，并注意清沟沥水，谨防渍涝。2、对棉株发育迟缓，红茎到顶，叶小色黄的棉田宜早施并加大肥料用量，如尿素用量每亩可在8公斤左右。另外，若发生连续干旱，土壤含水量低于田间持水量的60%时，应适时隔沟补水。
二、适期化控。进入雨季后，棉株极易发生疯长，引起蕾铃脱落，而及时用缩节胺或助壮素化控可稳定棉株生长，改善株型，多增蕾结铃。
三、勤整枝打顶。由于雨季棉株生长加快，其赘芽也易发生。因而，应于雨停间隙及时性时人工抹掉。当棉株长到预定的株型高度时，为打破和抑制顶端生生优势，减少上部无效果枝对养分的无谓消耗，促进棉铃发育等，应适时打顶。
四、科学治虫病。各种病虫害的发生与否，和雨季雨量状况关系极大。如若干旱就不利于棉铃虫卵的孵化和幼虫发育，但降水多雨量大也会阻碍其卵的孵化，尤其是暴雨对虫卵及初孵幼虫有较强的冲刷作用。倘若雨季降水少而均匀，则利于棉铃虫暴发流行。
五、适防自然灾害。进入雨季是诸如干旱、渍涝、冰雹、大风等灾害的易发期，在加强防御的基础上，还应对无法抗拒的灾害，采取措施加以挽救，以减轻危害。如对于冰雹危害后的棉田应及时浇水追肥，促其尽快恢复生机；其次是及时整枝打顶、化控，并注意防治病虫害。对于受涝灾后的棉花，一是及早清理、疏通排水系统，排除积水；其次是中耕松土，增施肥料，防止脱肥旱衰。