采用新土育苗或床土消毒。每㎡床面用50%多菌灵可湿性粉剂8～10克，加堰土4～5公斤拌匀，先将1/3药土撒在畦面上，然后播种，再把其余药土覆在种子上。
倒茬轮作，选抗病品种，种植前土壤消杀处理。
西红柿根腐病防治措施1.农业措施。做好西红柿苗床土壤消毒工作，培育无病壮苗。平整土地，做好排灌系统、高畦栽培。重病地与非茄果类、瓜类蔬菜实行3年以上轮作。加强水肥管理，适时适量灌水，浇小水，切忌大水漫灌。雨后及时排水，浇水后及雨后适时中耕松土。施用充分腐熟的粪肥，增施磷、钾肥，避免肥料施用不当烧伤根系.。
倒茬轮作，选择抗病品种，种植前对土壤消毒处理。
番茄根腐病应该在初发期开始用杀菌药防治。
选择优良品种，适时适量浇水施肥，加强病虫害防治。
根腐病，在发病初期喷施50%敌磺钠可湿性粉剂1000倍液，或用中生菌素水剂800倍液，喷匀为度23%络氨铜水剂800倍液，喷匀为度。
防治根腐病的药物有多菌灵、三乙磷酸铝、敌磺钠等。
采用农业防治与化学防治相结合的方法。