从清理病菌源来说，物理防治和化学药物防治2个方面对其进行防治。物理防治可以采取刮粗皮，将病虫害枝进行修剪并集中清理。化学药品可使用福美胂可湿性粉剂100倍或75%五氯酚钠粉100-200倍液。为了提高轮纹病的预防效果，降低受害损失，应在每年的，3月中下旬到4月初进行喷施药剂。在幼果期可以选择在落花后期间进行喷药，使用50%复方多菌灵悬浮剂1000倍，或30%绿得保胶悬剂300倍，或索利巴尔60-80倍液喷雾防治，一个月2次。进入8月可使用福美砷30-50倍液涂刷粗皮病部。可加药液1%的腐殖酸钠，促进健皮生长。
预防和治疗苹果轮纹病有两种方法，可用物理防治和化学药剂防治。