在种植感病寄主和土壤有足够菌量时，播种后至幼苗4－5叶期土壤的温湿度成为病菌侵染多少的决定因素，因此春播、早播、土壤偏干和冷凉山区发病重。品种抗性有明显差异。长期连作感病品种，由于增加土壤菌量，可加重病害的流行。
部分品种容易发生玉米黑穗病。
玉米黑穗病是品种抗病害能力弱、早春播种温度过低、土杂肥使用时未充分发酵、种植过密、种衣剂使用不当等原因引起的。要预防该病害发生，可在播前用甲基托布津、粉锈宁等药剂处理种子。
玉米收获后，厚垣孢子在土壤中或病株残体上越冬，成为第二年侵染来源，混入堆肥中和沾附在种子表面的孢子也是初侵染来源。春、夏季遇适宜温、湿度条件，越冬的厚垣孢子萌发产生担孢子，随风雨传播到玉米幼嫩组织或口十鞘基部缝隙而侵入。担孢子在水滴间差异更明显，一般较耐旱和果穗苞叶长而且包得紧的品种比较抗病，马齿型玉米和早熟品种也较抗病，农家品种多不抗病；连作地和距村庄近的地块，由于土壤中积累的菌源多，发病较重。雨水多，湿度大的年份发病重。种植密度过大，偏施氮肥以及玉米螟为害，冰雹、人为活动等造成伤口，利于病菌侵染。
玉米黑穗病发病原因是连作茬士壤中积累菌源多，发病较重，雨水多，湿度大年份发病重，种植密度大，偏施氮肥利于发病。
品种抗病害能力弱，种植过密引起。
玉米黑穗病长期连作病品种，土壤菌量，可加重病虫害。