发病初期喷洒60%琥·乙膦铝可湿性粉剂500倍液或70%乙·锰可湿性粉剂500倍液、58%甲霜灵·锰锌500倍液、64%杀毒矾M8可湿性粉剂500倍液、72.2%普力克水剂800倍液，隔7～10天1次，连续防治2～3次。
化学防治①种子消毒。用0.8%醋酸处理种子24小时、5%盐酸处理5～10小时、1.05%次氯酸钠处理30分钟或0.05%氯化汞处理5分钟。②发病初期可选用72%农用链霉素可湿性粉剂5000倍液、2%春雷霉素可湿性粉剂300～400倍液、52%丰护安可湿性粉剂600～800倍液、47%加瑞农可湿性粉剂600～800倍液、1∶1∶200倍波尔多液等进行喷施，7～10天1次，连续喷2～3次。
辣椒叶斑病以防为主，用杀毒巩或农用链霉素等药防治。
选择抗性品种；种子消毒；育苗床消毒；培育壮苗增强抵抗能力；轮作；加强田间管理；化学防治；清洁田园。