主要病害有猝倒病可以使用猝倒立枯灵800倍液或是苗菌敌800-1000倍液；花叶病可以使用小叶黄绝1000-1500倍液或者病毒灵1500-2000倍液喷雾治疗。主要虫害是潜叶蝇，使用40%乐果乳油1000倍液或40%二嗪农乳油1000～1500倍液；蓟马可以使用25%吡虫啉1000倍喷雾或是25%噻虫嗪水分散粒剂3000-5000倍灌根。
百香果猝倒病会危害百香果幼苗，可采用苗菌敌、丙森锌进行喷施防治；茎基腐病会危害到根茎，可采用多菌灵进行喷施防治；如果出现虫害，可选用阿维菌素、利劈螨等杀虫剂防治。