沼气池的启动与管理是否科学，对沼气池的产气率高低影响很大。要想使新建沼气池投料后正常高效运转，就必须把握好沼气池发酵启动和日常管理技术要领，密切控制和及时调整发酵条件(温度、浓度、酸碱度)，提高沼气产量和质量。
新建成或大换料的沼气池，从向沼气池投入发酵原料和接种物开始，到能够正常而稳定地产气的过程，称为沼气发酵的启动。沼气池发酵能否顺利启动，对于沼气池能否长久稳定运行非常重要。启动顺利的沼气池，封池后3～5天内即可点火使用。启动不顺利的沼气池，封池后十天半月甚至更长时间都不能点火使用，有的甚至产生（偏酸）发酵抑制，需要重新配料启动。要使新建成的沼气池投料后能很快正常运转，产气速度快、产气量高，应采用以下技术要点。
一、加入丰富的沼气菌种
一般投入的新鲜发酵原料本身带有的菌种很少，如果不预先富集和加入沼气菌种，将会迟迟不产气或产气甚微，所产沼气中的甲烷含量也很少，沼气质量差。沼气池启动时，应加入丰富的沼气菌种，以缩短沼气发酵的停滞期，加快产气速度，提高沼气产量和质量。一般新池投料或旧池大换料，应加入占原料量30%以上的接种物，或保留10%以上正常发酵的沼气池底部沉渣，或用10%～30%的沼气发酵料液作接种物。
沼气菌种在自然界中广泛存在。阴沟污泥、城市下水道污泥、屠宰场、酒厂、食品加工厂的污水污泥、正常发酵的沼气池底部污泥和发酵料液，以及陈年老粪坑底部粪便、堆沤腐熟的动植物残体等，均富含沼气微生物，特别是产甲烷菌群，都可采集为接种物。
若接种物需要量大，当地又难获取，可进行扩大培养。其方法是将所选取的接种物，按10～30%的比例，加入发酵原料中，厌氧富集培养。每天搅动一次，直到所产气体的甲烷含量达到50%以上或能正常燃烧，即可使用。如一次扩大培养仍不够用，可继续扩大培养，直到满足需要为止。
新建沼气池，若无法采集接种物，可用堆沤10天以上的畜粪或陈年老粪坑底部粪便作接种物。用量仍占原料量的30%以上。实践表明，牛粪既是一种很好的接种物又是最好的启动发酵原料。
二、选择优质原料并堆沤处理
沼气发酵原料既是生产沼气的物质基础，又是沼气微生物赖以生存的营养物质来源。各种有机物质，如人畜禽粪尿、作物秸秆、农副产品加工的废水剩渣及生活污水等都可做沼气发酵原料。为保证沼气池启动和发酵有充足而稳定的原料，用于启动的第一池原料应尽量选用有机营养适合的牛粪、羊粪或马粪，或者用1/2的猪粪，搭配1/2的牛、马粪混合后启动。因为这类物质原料颗粒较细，含有较多的低分子化合物，氮素的含量高，其碳、氮比都小于25：1，都在适宜发酵的碳、氮比之内，用其作发酵原料启动快，产气好。切忌单独用鸡粪、人粪或甘薯渣启动，因为这类原料在沼气细菌少的情况下，料液易酸化，使发酵不能正常进行。
不论用猪粪或牛粪启动，都应进行池外堆沤，使发酵细菌大量繁殖，减缓酸化作用，并防止料液入池后干粪飘浮于上层而结壳，或产酸过多，使发酵受阻。堆沤时，在粪堆上泼水，保持其湿润，并加盖塑料薄膜，以聚集热量和富集菌种。一般情况下，夏季堆沤3～5天，春季堆沤6～8天，使发酵原料的温度达到40度以上。
三、装料加水
新池启动，原料要加足，投料量应为池子容积的80～85%。如果预留气箱容积过大，产气后，需较长时间才能排出残存的空气。当发酵原料进完后，分别从进出料口加水，加入的水最好是温度较高的污水、粪水或其它沼气池的沼液，切忌将从井里抽出的冷水直接加入池内，以免使沼气池处于“冷浸”状态，难以启动。装料最好选择气温、水温较高的晴天中午或下午进行，以利于发酵。一般情况下，发酵原料浓度掌握在6～12%为宜。合适的启动进料量应根据沼气池发酵启动的有效容积、发酵原料的品种及含水量、启动所用的浓度等进行计算。