防治方法（1）因地制宜地选用抗病良种。（2）药剂处理种子是防治高粱黑穗病最重要，最简单，最有效的粉法。①2%立克秀按种子重量的0.1—0.2%拌种（米汤拌种）或50%禾穗胺按种子重量的0.5%拌种子。②用20%粉锈宁乳油100毫升，加少量水，拌种100公斤，力求混凝土拌均匀，摊开晾干后播种。③用20%萎锈灵乳油（或可湿性粉剂）0.5公斤，加水3公斤拌种40公斤，闷种4小时，晾干后播种。（3）实行3年以上轮作，以减少土中菌量，是防治黑穗病的重要措施。（4）提倡适期晚播，争取早出苗、出全苗。及时砍倒病株，在灰包破裂之前，将病株砍倒拉出地外集中销毁。
该病一般在穗期才表现症状，极少数病株在生长前期也表现出症状，即植株矮小，节间缩短，叶片簇生，有的分蘖丛生；穗期受病雄穗，花器基部膨大，颖片增多，内含黑色粉末，受病雌穗穗形短小，基部膨大，果穗内部充满黑色粉末和扭曲的丝状物。防治方法。1、种植抗病品种。2、及时摘除病瘤或拔除病株，收获后清洁田园，减少初侵染源，重病区避免连作，实行轮作。3、精耕细作，适期播种，促使种子发芽早，出土快，减少发病。4、药剂防治，用种子量0.5%的15%粉锈宁可湿性粉剂，0.8%的50%敌克松可湿性粉剂，0.2%的50%福美双可湿性粉剂，或用种子量0.3%的12.5%烯唑醇（速保利）可湿性粉剂进行药剂拌种。
要贯彻预防为主综合防治植保方针。