大豆紫斑病在开花结荚初期用多菌灵或甲基托布津喷施，效果好。
在开花始期、蕾期、结荚期、嫩荚期各喷1次30%碱式硫酸铜(绿得保)悬浮剂400倍液或1：1：160倍式波尔多液、50%多·霉威(多菌灵加万霉灵)可湿性粉剂1000倍液、50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液、36%甲基硫菌灵悬浮剂500倍液，每667平方米喷对好的药液55L左右。
在叶发病初期和开花结荚期喷药，每隔7～10d防治1次，连续防治2～3次。药剂可选用50%多菌灵可湿性粉剂800倍液（667m2用药量125g）或70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液（667m2用药量100g）等。