小麦发芽感病后，芽鞘变褐色，严重时烂芽枯死。秋苗至返青期感病，叶鞘上出现中部灰色、边缘褐色的病斑。叶片渐呈暗绿色水渍状，以后失水枯黄甚至死亡。
要防治小麦纹枯病，可以采用农业和化学措施来进行防治。因此在播种前使用粉锈宁进行拌种，并合理施用磷钾肥提高植株抗病力。
病鞘与茎秆之间或病斑表面，常产生白色霉状物。在上面，初期散生土黄色或黄褐色的霉状小团，担孢子单细胞，椭圆形或长椭圆形，基部稍尖，无色。
主要发生在小麦的叶鞘和茎秆上。小麦拔节后，症状逐渐明显。发病初期，在地表或近地表的叶鞘上产生黄褐色椭圆形或梭形病斑，以后，病部逐渐扩大，颜色变深，并向内侧发展为害茎部，重病株基部一、二节变黑甚至腐烂，常早期死亡。小麦生长中期至后期，叶鞘上的病斑呈云纹状花纹。病斑无规则，严重时包围全叶鞘，使叶鞘及叶片早枯。在田间湿度大，通气性不好的条件下，病鞘与茎秆之间或病斑表面，常产生白色霉状物。