造成玉米籽粒干瘪的原因，主要是水肥不足。
水肥不足，浇不上水，授粉不够。
想要知道玉米的瘪粒和缺粒的原因，首先要知道玉米是如何授粉的。玉米的花分为雌花和雄花，雄花长在玉米植株的顶端，像扫帚一样的穗，而雌花则是长在玉米的中部，位于叶鞘里。成熟的雌花会伸出很多的像胡须一样的须子，这是雌花的雌花蕊，每一根“胡须”将来都可以形成一颗玉米。当雄花的花粉从顶端落下，落到那些"胡须"上的时候，就完成了授粉，将来就会长成一颗玉米。再“胡须”干瘪失去授粉前如果还没有花粉的话，那这颗玉米将来就会缺粒；如果授粉不良或授粉过迟，那就会形成瘪粒。同时，由于一些微量那个元素的缺失。
原因是蜡熟-完熟期，冻害和早衰，早衰主要由于干旱、高密、叶部病害、缺钾和冰雹等引起。