药剂灌根：在黄瓜枯萎病发生初期，可用6%春雷霉素可湿性粉剂150-225倍液，进行灌根，每次间隔7～10天，连灌2～3次，通过干扰病菌氨基酸的代谢酯酶系统，从而影响蛋白质的合成，抑制菌丝伸长和造成细胞颗粒化。达到防治枯萎病的目的。
黄瓜枯萎用多菌灵或者甲基托布津。
用2.5%适乐时悬浮剂200倍液加57.6%农多福15克，每株灌药250毫升，每5-7天灌1次，连灌3次。用43%好立克3毫升加冠菌乐8毫升加水灌根，每株灌药250毫升，每7天灌1次，连灌3次。用30%甲霜恶霉灵500倍液加33.5%喹啉酮25毫升灌根，每株灌药250毫升，每5-7天灌1次，连灌3次。用60%百泰可湿性粉剂800倍液加77%多宁可湿性粉剂600倍液灌根，每株灌药250毫升，每7天灌1次，连灌3次。以上配方任选择一种，交替使用，如果及时治疗，效果可达85%以上。
选用抗病品种，加强物理化学防治。