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小麦各生育期均可受害，造成烂芽、病苗死苗、花秆烂茎、倒伏、枯孕穗等多种症状。烂芽是在种子发芽后，芽鞘受侵染变褐，继而烂芽枯死，不能出苗。病苗死苗主要在小麦3～4叶期发生，在第一叶鞘上呈现中央灰白、边缘褐色的病斑，严重时因抽不出新叶而造成死苗。
小麦纹枯病主要危害小麦根茎。
小麦纹枯病主要发生在叶鞘和茎秆上。
小麦纹枯病主要危害小麦秸秆。
