一、按土壤和作物选择复合肥料的品种。只有因地制宜，才能发挥其肥效。二、复合肥料应与单质肥料配合施用。复合肥中的营养成份是固定的，只有与各种单质肥料配合施用，才能满足作物不同时期对养分的需求。一般来说复合把适合作基肥，而单质肥料可作追肥施于作物需肥的高峰期和关键期。三、要方法得当。各种复合肥中，各种营养成分的比例和形态是不一样的，加上土壤和作物种类不同，施肥的方法也不应一样，要区别对待。四、粘性土壤保肥力强应深施，沙质土壤易脱肥，可少量多次施用。
复合肥在长生育期作物，应用作基肥深施。
复合肥一般十天见效，肥效长，要深施覆土。