1、不从发病地区调种，病田蒜头不作种用。严防随种蒜传入无病田块。蒜种用50%甲基硫菌可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂处理后再播种。具体方法是将0.5千克药剂对水3~5千克，把50千克蒜种拌匀，晾干后播种，可有效切断初侵染途径。或用15%粉锈宁可湿性粉剂或70%甲霜铝铜可湿性粉剂拌种。2、连作的田块容易发病，因此对连作田块进行与非寄主作物（禾本科、十字花科、茄科、葫芦科等）轮作2~3年，可有效此病。3、早春进行追肥提苗，松土、排涝降渍，促进大蒜生长，提高抗病能力，发现病株及时挖除，带出田间晒干烧掉，严禁沤肥，以防把病菌再带入田间。病株周围土壤也要挖走深埋，并填以无菌土壤。
果腐病主要危害果实。从开花期至成熟期均可发病。幼果发病时病部变为黑褐色，后干枯，硬化，如皮革，故又称为革腐。成熟果发病，病部白腐软化，似开水烫伤。从花期开始喷药，常用药剂有40%三乙膦酸铝可湿性粉剂150～200倍液，50%甲霜铜可湿性粉剂600倍液。
要防治大蒜病毒病，应实施3至4年轮作，并选用脱毒大蒜进行播种，同时加强栽培管理，培育壮苗。在发病后，及时用药进行防治，可选用病毒a可湿性粉剂或植病灵乳油进行喷施。
大蒜白腐病，从花期开始喷药，用40%三乙膦酸铝可湿性粉剂150一200倍液。