肉苁蓉：呈扁圆柱形，稍弯曲，长3~5厘米，直径2~8厘米，表面棕褐色或灰棕色，气味甜，微苦。
管花肉苁蓉：呈扁圆柱形、扁纺锤形、扁卵圆形、扁圆形等不规则形，长6~8厘米，直径4~6.5厘米，表面红棕色、灰黄棕色或棕褐色，多扭曲，气微，味甜、微苦。
一、管花肉苁蓉与肉苁蓉有什么不同
1、肉苁蓉：呈扁圆柱形，稍弯曲，长3~5厘米，直径2~8厘米，表面棕褐色或灰棕色。密被覆瓦状排列的肉质鳞叶，通常鳞叶先端已断。体重、质硬、微有柔性、不易折断，断面棕褐色，有淡棕色点状维管束，排列成波状环纹。气微味甜、徽苦。
2、管花肉苁蓉：呈扁圆柱形、扁纺锤形、扁蛋圆形、扁圆形等不规则形，长6~8厘米，直径4~6.5厘米，表面红棕色、灰黄棕色或棕色，多扭曲。密被略呈覆瓦状排列的肉质鳞片，上部密下部疏、鳞片先端多已断落，残基部宽多在l厘米以上，整个鳞片略呈长三角形，高约1厘米。体重、质坚硬，无韧性，难折断，断面颗粒性，多呈灰棕色，有的外圈呈黑色硬胶质样。黑褐色点状维管束众多，不规则散在，有的有小裂隙。气微，味甜、微苦。
二、有效成分含量差异
1、肉苁蓉简称软大芸，油苁蓉，寄生在梭梭根部，主要产品为内蒙阿拉善地区，因成分多糖，晾干后非常柔软。荒漠肉苁蓉松果菊苷的含量100g当中含0.3g左右。因产稀少，市场价格略高于管花肉苁蓉。因产品油性大，开水冲泡后发黑，连续冲泡多次颜色依旧发黄。更多消费者故以为效果会更好，因此一般中药房选用比较广泛。
2、管花肉苁蓉寄生于红柳根部，主要产区为新疆和田。晾干后非常硬，被药商誉为硬大芸。管花肉苁蓉鲜材的松果菊苷和麦角甾苷一般含量在100g中含有1.5g~4g，年份越高含量越多，会随着水分的流失而减少。由于有效成分含量高，因此在制药方面应用广泛。