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辣椒青枯病的防治必须因地制宜，综合实行各种有效的防治措施。综合防治策略是：以抗病品种为基础，田间管理为重点，在控制菌源前提下，加强农业措施，辅以药剂防治。
清除病株出田，集中处理，土壤消杀。
增施有机肥和生物菌肥能有效预防减少辣椒青枯病。
