防治方法。1、因地制宜地选用适合当地栽培的抗根腐病的品种，种植不带黑胚的种子。2、提倡施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟的有机肥。麦收后及时耕翻灭茬，使病残组织当年腐烂，以减少下年初侵染源。3、采用小麦与豆科、马铃薯、油菜等轮作方式进行换茬，适时早播，浅播，土壤过湿的要散墒后播种，土壤过干则应采取镇压保墒等农业措施减轻受害。
选育抗病品种；加强栽培防病措施，控制苗期病害的关键是适时播种,施足基肥,及时追肥,覆土不宜过深,麦田不连作；药剂拌种，用25%粉锈宁或50%福美双或50%扑海因可湿性粉剂拌种。
小麦根腐病防治，选用抗病品种，增施有机肥和磷钾肥，清除病残体，合理轮作，加强肥水管理，用笨醚甲环唑等农药拌种，发病初期用恶霉灵等农药喷施防治。