尸体剖检所观察的特征是急性肠炎，局限于空肠和回肠，炎症反应较轻，仅黏膜出现浊样颗粒化，有的可见整个黏膜的严重坏死性肠炎。眼观特征是黄色纤维素坏死性假膜松弛地附着在充血的黏膜上。乳糜的吸收随病情的严重性而变化。显微镜下检查发现空肠和回肠的绒毛变短，约为正常长度的一半，其顶部可能有溃疡与坏死。在有些病例，坏死遍及整个黏膜，球虫内生发育阶段的各型虫体存在于绒毛的上皮细胞内，少见于结肠。在病程的后期，可能出现卵囊。
猪剖检可见为急性肠炎特征，肠系膜淋巴结充血、肿大，肠道黏膜有出血斑，可见不同程度的坏死，黏膜上有黄色假膜附着，肠腔内容物为暗红色糊状纤维素性物质，气味酸臭。显微镜下观察可在黏膜上皮细胞内看见发育阶段的虫体。
尸体剖检所观察的特征是急性肠炎，局限于空肠和回肠，炎症反应较轻，仅黏膜出现浊样颗粒化，有的可见整个黏膜的严重坏死性肠炎。眼观特征是黄色纤维素坏死性假膜松弛地附着在充血的黏膜上。乳糜的吸收随病情的严重性而变化。
急性肠炎性局限于空肠和回肠，炎症反应较轻，仅黏膜出现浊样颗粒化，有的可见整个黏膜的严重坏死性肠炎。眼观特征是黄色纤维素坏死性假膜松弛地附着在充血的黏膜上。乳糜的吸收随病情的严重性而变化。
解剖之后发现回肠、小肠、空肠有出血斑，肠粘膜出血、糜烂和坏死的症状。刮取其粘膜进行检查，发现球虫卵囊。在粪便中用饱和盐水漂浮也能发现球虫卵囊。
解剖所观察的特征是急性肠炎，局限于空肠和回肠，炎症反应较轻，仅黏膜出现浊样颗粒化，有的可见整个黏膜的严重坏死性肠炎。