一、间苗与补苗
当薏苡苗高5~10厘米时，结合松土除草进行间苗定苗，条播的按株距10~15厘米定苗，若有缺株，应及时补苗。穴播的每穴留苗3~4株。
二、中耕除草
在薏苡苗期要勤松土除草，一般进行3次。第一次在苗高5~10厘米时结合间苗进行；第二次在苗高30厘米左右，应浅松土，促进分蘖；第三次在苗高40~50厘米，植株封行前进行，此时正值拔节期，应结合追肥进行培土，以促进根系生长和防止植株倒伏。封垄后一般不再松土除草。
三、追肥
结合中耕除草进行，一般3次。
第一次（苗肥）于苗高5~10厘米左右时，每亩施入腐熟的人畜粪尿1000~1200千克，或硫酸铵10~15千克，以促进幼苗生长健壮和分蘖；
第二次（穗肥）在苗高40厘米，此时进入孕穗期，每亩追施人畜粪水1500千克，或尿素15千克、过磷酸钙20千克、钾肥（硫酸钾或氯化钾，有利孕穗）10千克，并结合中耕培土，把肥料埋入土中；
第三次（粒肥）在基本齐穗之后，为了促进粒重，防止植株早衰，可每亩追施人畜粪尿1500千克或硫酸铵10千克。此时根外追施磷钾肥（浓度为2%左右），对增加粒重，提高产量亦有显著效果。
四、灌溉排水
根据薏苡的湿生习性，田间水分管理以干湿相间为原则。即湿润育苗、干旱拔节、有水孕穗、足水抽穗、湿润灌浆、干田收获。根据情况灌水和排水。
五、摘除脚叶
在薏苡拔节期后，应摘除第一分枝以下的脚叶和无效分蘖，以便株间通风透光，促进茎秆粗壮，防止植株倒伏，减轻病害。
六、人工辅助授粉
薏苡是雌雄冋株，为风媒花，但在扬花期，雄花少或风力不足时，雌花就不能全部授粉，会形成空瘪粒。为提高产量，在花期每隔3~4天，用绳子或长竹竿顺行振动植株上部，进行人工辅助授粉，使花粉飞扬，便于传粉，提高结实率。