1、提早播种。青枯病一般6月上中旬发生，为了避免发病高峰期与结果盛期相遇，可提早播种。2、选择排水良好的沙壤土栽培。土壤深翻后喷洒新高脂膜800倍液，给土壤，保温保墒，有利于种子萌芽生长。3、实行三年以上轮作。青枯病可为害多种茄科作物，凡前作是番茄、茄子、辣椒的，均不宜种辣椒。4、注意排水。青枯病菌可随水流传播，应用高垄窄畦栽培，注意及时排水，畦内不能积水。5、整枝、松土、追肥等工作，应在发病期前完成，发病以后，特别注意不能松土锄草，如有杂草，只能用手拔除，以免伤根。6、发现病株，及时拔除，穴内及邻近土壤喷洒护树将军，防止蔓延。
选育和种植抗耐病良种是防治辣椒青枯病最经济有效的办法。
加强田间肥水管理及时防治工作。
①选用抗青枯病的品种，如辣优15号、粤红1号。
辣椒青枯病应以预防为主，建议使用新型蛋白农药“信号施康乐”进行预防，新型蛋白农药“信号施康乐”能从内在激发辣椒植株对青枯病、炭疽病、疫病等常见病害的主动防御能力，提升植株对病害抵抗能力，防效达70%以上。
辣椒青枯病的防治必须因地制宜，综合实行各种有效的防治措施。综合防治策略是：以抗病品种为基础，田间管理为重点，在控制菌源前提下，加强农业措施，辅以药剂防治。
1、提早播种。2、选择排水良好的沙壤土栽培。3、实行三年以上轮作。4、注意排水。5、整枝、松土、追肥等工作，应在发病期前完成，发病以后，特别注意不能松土锄草，如有杂草，只能用手拔除，以免伤根。6、发现病株，及时拔除，穴内及邻近土壤喷洒护树将军杀菌消毒，防止蔓延。
青枯病细菌性病害用中生霉素，叶枯唑乙酸素，枯草芽孢杆菌提前预防。种植前提前土壤处理一下。
一、培育壮苗。壮苗的抗病能力强，是保证齐苗的基础。二、移栽时尽量减少植伤。一是移苗时轻拿轻放，尽量减少断根；二是栽种时一定要顺根，不能为了赶工让根挤成一团。三、严格实行轮作制。耕作制度实行与非茄科作物轮作或水、旱轮作。四、在定植后至开花结果期及早淋药预防，比发病后施药对预防和减轻发病效果更好。这期间定期或不定期淋施或结合沟灌，用高锰酸钾600倍液，或硫酸铜1000倍液，或铜氨液600～800倍液，2～3次或更多，发病后继续挑治，封锁发病中心，可减轻危害。
加强水肥管理，做好病虫害防治。