可以采取综合防治措施进行。
辣椒青枯病，青枯病属于细菌性的病害，建议拔除发病的出去销毁，然后专建议用噻森铜，属或噻菌铜，或农用链霉素，或中生菌素，或噻霉酮，或奎啉铜等药交替或选择两个不同机理的成分加生根剂混用防治。5-7天一次，连续淋洒根部处2次以上。
选用抗病品种，加强田间管理。
采用高垄或半高垄栽培方式，配套田间沟系，降低田间湿度，同时增施磷、钙、钾肥料，促进作物生长健壮，抗病能力提高，能减轻青枯病发生。
辣椒青枯病的防治必须因地制宜，综合实行各种有效的防治措施。综合防治策略是：以抗病品种为基础，田间管理为重点，在控制菌源前提下，加强农业措施，辅以药剂防治。
选择优质品种，做好水肥管理，及时防治病虫害。
辣椒青枯病属于细菌性病虫害，应加强土壤消毒，病残枝焚烧或深埋。
1、实行轮作。青枯病可危害多种茄科作物，前茬作物为番茄、茄子、辣椒、豆类等均不宜种植辣椒，尽量与禾本科作物或瓜类4年以上轮作，这样土壤中病菌基数才会降下来而减少病害发生。2、消毒处理。辣椒种子用恶霉灵拌种，每公斤种子用原药0.5~1克均匀拌种。