临床主要表现为出生后1周开始出现以灰色为主、黄白色为辅的下痢便，恶臭，初始时粪便松软或呈糊状，随着病情加重粪便呈液体样，有的粪便呈白色至灰白色凝乳块状，有的表现黄色水样腹泻。仔猪被毛粗乱无光泽，皮肤灰白，缺乏弹性:眼窝下陷;生长发育缓慢，严重消瘦，体重几乎不增加;喜卧，弓背站立，可持续2-天，行走不稳。
主要为发热，腹泻，一般呈现良性经过，可自行耐过而逐渐恢复，主要是急性肠炎，局限于空肠和回肠，呈现黄色纤维素性坏死的伪膜。
尸检观察到的特点是急性肠炎，局限于空肠和回肠，炎症反应较轻，只有粘膜出现浊样颗粒化，有整个粘膜的严重坏死性肠炎。眼观特征是黄色纤维素坏死性假膜松弛附着在充血的粘膜上。乳糜的吸收随病情的严重性而变化。
尸体剖检所观察的特征是急性肠炎，局限于空肠和回肠，炎症反应较轻，仅黏膜出现浊样颗粒化，有的可见整个黏膜的严重坏死性肠炎。眼观特征是黄色纤维素坏死性假膜松弛地附着在充血的黏膜上。乳糜的吸收随病情的严重性而变化。显微镜下检查发现空肠和回肠的绒毛变短，约为正常长度的一半，其顶部可能有溃疡与坏死。在有些病例，坏死遍及整个黏膜，球虫内生发育阶段的各型虫体存在于绒毛的上皮细胞内，少见于结肠。在病程的后期，可能出现卵囊。[。