急性型：多见于幼犊。表现高热，持续2～3天，有的呈双相热型。腹泻，呈水样，粪带恶臭，含有黏液或血液。大量流涎、流泪，口腔黏膜(唇内、齿龈和硬腭)和鼻黏膜糜烂或溃疡，严重者整个口腔覆有灰白色的坏死上皮，像被煮熟样。孕牛可引起流产，犊牛先天性缺陷(如小脑发育不全、失明等)。慢性型：较少见，病程2～6个月，有的达1年。病畜消瘦，呈持续或间歇性腹泻，里急后重，粪便带血或黏膜。鼻镜糜烂，但口腔内很少有糜烂。蹄叶发炎及趾问皮肤糜烂坏死，致使病畜跛行。
牛病毒性腹泻的症状表现分作急性型与慢性型两种：急性型：幼犊更常见。症状表现为高热，持续二至三天，部分呈双相热型，伴有水样腹泻，粪带恶臭，可见黏液或血液，流涎、流泪现象明显，口腔粘膜以及鼻黏膜糜烂或溃疡，症状严重的情况下整个口腔均可见灰白色坏死上皮。孕牛易引发流产，犊牛容易出现失明、小脑发育不全等先天性缺陷。慢性型：通常较少见，病程在二至六个月间，可长达一年，病牛日渐消瘦，伴有间歇或持续性腹泻，可见血迹或黏膜混迹于粪便中。
发病时多数牛不表现临床症状，牛群中只见少数轻型病例。有时也引起全牛群突然发病。急性病牛，腹泻是特征性症状，可持续1～3周。粪便水样、恶臭，有大量粘液和气泡，体温升高。