于发病期前的6月下旬先用一次杀菌剂消灭树上病源，可选70%甲基托布津800倍液、50%多菌灵800倍液、40%新星乳油800倍液等；临近发病期可结事枣锈病防治，于7月中、下旬喷1次倍量式波尔多液200倍液或77%可杀得可湿性粉剂400～600倍液；发病期的8月中旬左右，选用1000万单位农用链霉素（第百万单位对水6～8千克）或10%多氧霉素1000倍液交替使用，并混入80%代森锰锌（喷克，大生M-45、新万生）可湿性粉剂800倍液或40%新星乳油10000倍液（或甲基托布津多菌灵等，使用浓度见说明），每10～15天1次，至9月上、中旬一般结束用药。
于发病前，一般在6月下旬，低毒化学药剂喷施，消灭树上病源；临近发病期可结合枣锈病的防治，于7月中下旬再喷一次；在发病期，一般为8月中旬左右，每10—15天喷施1次，连喷2—3次。进入7月中旬正是防治枣树炭疽病的关键时期，可于7月上旬开始喷施800倍液的噻唑锌加新高脂膜800倍液或1：2：200的波尔多液，每隔7～10天喷一次，连喷2次。发病前或发病初期，也可以喷50%的多菌灵700倍液加新高脂膜800倍液，对防治枣树炭疽病效果较好。