种子带病，气候湿润是发病主要因素
小麦腥黑穗病是系统侵染病害，病菌侵入小麦幼苗的最适温度为9-12℃，病情轻重受菌源量、土壤温湿度、光照、栽培管理等条件影响。菌量高，发病重；冬麦晚播、春麦早播或播种较深，小麦出土慢，增加病菌侵染机会，发病重；地下害虫发生重的田块，幼苗受虫为害伤口多，利于病菌侵染，发病重。
小麦腥黑穗病是系统侵染病害。
黑穗病是花器侵染病害，一年只侵染一次。带菌种子是病害传播的唯一途径。病菌以菌丝潜伏在种子胚内，外表不显症。当带菌种子萌发时，潜付的菌丝也开始萌发，随小麦生长发育经生长点向上发展，侵入穗原基。
小麦黑穗病有两种，一种腥黑穗病，一种散黑穗病
温度适宜、土壤湿润时容易发生。
小麦黑穗病发病条件是受气候、湿度、光照等因素导致成的。
小麦腥黑穗病发病的气象条件是：气温9到12度，相对湿度小于40%。
凡是影响小麦幼苗出土快慢的因素均影响病害发生。
小麦腥黑穗病菌的厚垣孢子能在水中萌发，有机肥浸出液对其萌发有刺激作用。萌发适温16—20℃。病菌侵入麦苗温度5—20℃，适合9—12℃。湿润土壤（土壤持水量40%以下）有利于孢子萌发和侵染。